El Banco de Sangre y Tejidos de Aragón obtuvo la certificación ISO 9001:2008 el 23 de noviembre de 2009, siendo la correspondiente certificación expedida por Bureau Veritas España.

El 15 de noviembre de 2010 obtuvo la certificación del Comité de Acreditación de Transfusiones (CAT) , conforme a los estándares en Transfusión Sanguínea CAT 3ª edición (2006).

En marzo de 2011 se inauguró el Banco de Leche Materna, cuya certificación según la Norma ISO 9001:2008 se obtuvo en septiembre de 2012.

Todas las certificaciones se mantienen vigentes mediante las preceptivas inspecciones anuales.